TranslateProject/published/20141211 How to use matplotlib for scientific plotting on Linux.md

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在Linux中使用matplotlib进行科学画图

如果你想要在Linxu中获得一个高效、自动化、高质量的科学画图的解决方案应该考虑尝试下matplotlib库。Matplotlib是基于python的开源科学测绘包基于python软件基金会许可证发布。大量的文档和例子、集成了Python和Numpy科学计算包、以及自动化能力是作为Linux环境中进行科学画图的可靠选择的几个原因。这个教程将提供几个用matplotlib画图的例子。

###特性###

  • 支持众多的图表类型bar,box,contour,histogram,scatter,line plots....
  • 基于python的语法
  • 集成Numpy科学计算包
  • 数据源可以是 python 的列表、键值对和数组
  • 可定制的图表格式(坐标轴缩放、标签位置及标签内容等)
  • 可定制文本(字体,大小,位置...)
  • 支持TeX格式等式符号希腊字体...)
  • 与IPython相兼容允许在 python shell 中与图表交互)
  • 自动化(使用 Python 循环创建图表)
  • 用Python 的循环迭代生成图片
  • 保存所绘图片格式为图片文件png,pdf,ps,eps,svg等

基于Python语法的matplotlib是其许多特性和高效工作流的基础。世面上有许多用于绘制高质量图的科学绘图包但是这些包允许你直接在你的Python代码中去使用吗除此以外这些包允许你创建可以保存为图片文件的图片吗Matplotlib允许你完成所有的这些任务。从而你可以节省时间使用它你能够花更少的时间创建更多的图片。

###安装### 安装Python和Numpy包是使用Matplotlib的前提安装Numpy的指引请见该链接

可以通过如下命令在Debian或Ubuntu中安装Matplotlib

$ sudo apt-get install python-matplotlib 

在Fedora或CentOS/RHEL环境则可用如下命令

$ sudo yum install python-matplotlib 

###Matplotlib 例子###

本教程会提供几个绘图例子演示如何使用matplotlib:

  • 离散图和线性图
  • 柱状图
  • 饼状图

在这些例子中我们将用Python脚本来执行Mapplotlib命令。注意numpy和matplotlib模块需要通过import命令在脚本中进行导入。

np为nuupy模块的命名空间引用plt为matplotlib.pyplot的命名空间引用

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

###例1离散和线性图###

第一个脚本script1.py 完成如下任务:

  • 创建3个数据集xData,yData1和yData2)
  • 创建一个宽8英寸、高6英寸的图(赋值1
  • 设置图画的标题、x轴标签、y轴标签字号均为14
  • 绘制第一个数据集yData1为xData数据集的函数用圆点标识的离散蓝线标识为"y1 data"
  • 绘制第二个数据集yData2为xData数据集的函数采用红实线标识为"y2 data"
  • 把图例放置在图的左上角
  • 保存图片为PNG格式文件

script1.py的内容如下

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
 
xData = np.arange(0, 10, 1)
yData1 = xData.__pow__(2.0)
yData2 = np.arange(15, 61, 5)
plt.figure(num=1, figsize=(8, 6))
plt.title('Plot 1', size=14)
plt.xlabel('x-axis', size=14)
plt.ylabel('y-axis', size=14)
plt.plot(xData, yData1, color='b', linestyle='--', marker='o', label='y1 data')
plt.plot(xData, yData2, color='r', linestyle='-', label='y2 data')
plt.legend(loc='upper left')
plt.savefig('images/plot1.png', format='png')

所画之图如下:

###例2柱状图###

第二个脚本script2.py 完成如下任务:

  • 创建一个包含1000个随机样本的正态分布数据集。
  • 创建一个宽8英寸、高6英寸的图(赋值1
  • 设置图的标题、x轴标签、y轴标签字号均为14
  • 用samples这个数据集画一个40个柱状边从-10到10的柱状图
  • 添加文本,用TeX格式显示希腊字母mu和sigma(字号为16
  • 保存图片为PNG格式。

script2.py代码如下

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
 
mu = 0.0
sigma = 2.0
samples = np.random.normal(loc=mu, scale=sigma, size=1000)
plt.figure(num=1, figsize=(8, 6))
plt.title('Plot 2', size=14)
plt.xlabel('value', size=14)
plt.ylabel('counts', size=14)
plt.hist(samples, bins=40, range=(-10, 10))
plt.text(-9, 100, r'$\mu$ = 0.0, $\sigma$ = 2.0', size=16)
plt.savefig('images/plot2.png', format='png')

结果见如下链接:

###例3饼状图###

第三个脚本script3.py 完成如下任务:

  • 创建一个包含5个整数的列表
  • 创建一个宽6英寸、高6英寸的图(赋值1
  • 添加一个长宽比为1的轴图
  • 设置图的标题字号为14
  • 用data列表画一个包含标签的饼状图
  • 保存图为PNG格式

脚本script3.py的代码如下

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
 
data = [33, 25, 20, 12, 10]
plt.figure(num=1, figsize=(6, 6))
plt.axes(aspect=1)
plt.title('Plot 3', size=14)
plt.pie(data, labels=('Group 1', 'Group 2', 'Group 3', 'Group 4', 'Group 5'))
plt.savefig('images/plot3.png', format='png')

结果如下链接所示:

###总结###

这个教程提供了几个用matplotlib科学画图包进行画图的例子Matplotlib是在Linux环境中用于解决科学画图的绝佳方案表现在其无缝地和Python、Numpy连接、自动化能力和提供多种自定义的高质量的画图产品。matplotlib包的文档和例子详见这里


via: http://xmodulo.com/matplotlib-scientific-plotting-linux.html

作者:Joshua Reed 译者:ideas4u 校对:wxy

本文由 LCTT 原创翻译,Linux中国 荣誉推出